項(xiàng)目介紹
分子標(biāo)記是基于核酸分子多態(tài)性的遺傳標(biāo)記，其直接反應(yīng)DNA水平的遺傳變異。服務(wù)分類：SSR分子標(biāo)記、SNP基因分型、InDel標(biāo)記等。
簡單介紹
SSR（簡單重復(fù)序列）也稱微衛(wèi)星DNA，其串聯(lián)重復(fù)的核心序列為1~6 bp，其中最常見是雙核苷酸重復(fù)，如：(CA)n和(TG)n，每個(gè)微衛(wèi)星的核心序列結(jié)構(gòu)相同，重復(fù)單位數(shù)目10~60個(gè)，其高度多態(tài)性主要來源于串聯(lián)數(shù)目的不同。
SNP（單核苷酸多態(tài)性）指基因的某個(gè)堿基對(duì)出現(xiàn)替換缺失或增添而引起的堿基序列發(fā)生改變，最終導(dǎo)致DNA序列的多樣性，其中某一等位基因的突變頻率應(yīng)大于1%。
InDel是指在近緣種或同一物種不同個(gè)體之間基因組同一位點(diǎn)的序列發(fā)生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion-deletion), 是同源序列比對(duì)產(chǎn)生空位(gap)的現(xiàn)象。
樣本要求
植物樣本：葉片采用硅膠干燥后或干冰運(yùn)輸
動(dòng)物樣本：無水乙醇封存低溫運(yùn)輸
DNA：濃度為50-100ng/ul，至少15uL，干冰運(yùn)輸
服務(wù)流程
可提供結(jié)果內(nèi)容
A、電泳圖譜
B、測(cè)序結(jié)果
C、數(shù)據(jù)分析結(jié)果
D、實(shí)驗(yàn)報(bào)告
服務(wù)內(nèi)容及周期
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服務(wù)內(nèi)容 |
數(shù)量 |
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周期 |
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SSR引物開發(fā) |
40條特異性引物 |
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30個(gè)工作日 |
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基因組DNA提取 |
≤30個(gè)樣本 ＞30個(gè)樣本 |
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5個(gè)工作日 |
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引物合成 |
<60bp |
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5個(gè)工作日 |
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SSR引物篩選 |
PCR擴(kuò)增 PAGE篩選 |
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5個(gè)工作日 10個(gè)工作日 |
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SSR批量實(shí)驗(yàn) |
PCR擴(kuò)增 3730xl測(cè)序儀檢測(cè) |
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5個(gè)工作日 10個(gè)工作日 |