項目介紹
分子標記是基于核酸分子多態(tài)性的遺傳標記，其直接反應DNA水平的遺傳變異。服務分類：SSR分子標記、SNP基因分型、InDel標記等。
簡單介紹
SSR（簡單重復序列）也稱微衛(wèi)星DNA，其串聯(lián)重復的核心序列為1~6 bp，其中最常見是雙核苷酸重復，如：(CA)n和(TG)n，每個微衛(wèi)星的核心序列結(jié)構(gòu)相同，重復單位數(shù)目10~60個，其高度多態(tài)性主要來源于串聯(lián)數(shù)目的不同。
SNP（單核苷酸多態(tài)性）指基因的某個堿基對出現(xiàn)替換缺失或增添而引起的堿基序列發(fā)生改變，最終導致DNA序列的多樣性，其中某一等位基因的突變頻率應大于1%。
InDel是指在近緣種或同一物種不同個體之間基因組同一位點的序列發(fā)生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion-deletion), 是同源序列比對產(chǎn)生空位(gap)的現(xiàn)象。
樣本要求
植物樣本：葉片采用硅膠干燥后或干冰運輸
動物樣本：無水乙醇封存低溫運輸
DNA：濃度為50-100ng/ul，至少15uL，干冰運輸
服務流程
可提供結(jié)果內(nèi)容
A、電泳圖譜
B、測序結(jié)果
C、數(shù)據(jù)分析結(jié)果
D、實驗報告
服務內(nèi)容及周期
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服務內(nèi)容 |
數(shù)量 |
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周期 |
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SSR引物開發(fā) |
40條特異性引物 |
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30個工作日 |
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基因組DNA提取 |
≤30個樣本 ＞30個樣本 |
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5個工作日 |
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引物合成 |
<60bp |
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5個工作日 |
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SSR引物篩選 |
PCR擴增 PAGE篩選 |
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5個工作日 10個工作日 |
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SSR批量實驗 |
PCR擴增 3730xl測序儀檢測 |
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5個工作日 10個工作日 |